Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms