Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms