Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GGA2Q9UJY4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms