Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPUSD1Q9UJJ7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RPUSD1Q9UJJ7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms