Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEFF2Q9UIK5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms