Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII6

DUSP13, Dual specificity protein phosphatase 13 isoform B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP13Q9UII6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP13Q9UII6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms