Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKX1-2Q9UD57 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms