Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms