Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC6Q9UBN7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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