Protein–RNA interactions for Protein: Q9P258

RCC2, Protein RCC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC2Q9P258 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC2Q9P258 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms