Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC2

TREM2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREM2Q9NZC2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TREM2Q9NZC2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms