Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXV2

KCTD5, BTB/POZ domain-containing protein KCTD5, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD5Q9NXV2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCTD5Q9NXV2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms