Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM6Q9NX76 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM6Q9NX76 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM6Q9NX76 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM6Q9NX76 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM6Q9NX76 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM6Q9NX76 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM6Q9NX76 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM6Q9NX76 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM6Q9NX76 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM6Q9NX76 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM6Q9NX76 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM6Q9NX76 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM6Q9NX76 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM6Q9NX76 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM6Q9NX76 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM6Q9NX76 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM6Q9NX76 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM6Q9NX76 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM6Q9NX76 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM6Q9NX76 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM6Q9NX76 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM6Q9NX76 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM6Q9NX76 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM6Q9NX76 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CMTM6Q9NX76 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms