Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLE1Q9NVX2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NLE1Q9NVX2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms