Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREX1Q9NSU2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TREX1Q9NSU2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
TREX1Q9NSU2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TREX1Q9NSU2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TREX1Q9NSU2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX1Q9NSU2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX1Q9NSU2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX1Q9NSU2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX1Q9NSU2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX1Q9NSU2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX1Q9NSU2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX1Q9NSU2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX1Q9NSU2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX1Q9NSU2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX1Q9NSU2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX1Q9NSU2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX1Q9NSU2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX1Q9NSU2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX1Q9NSU2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX1Q9NSU2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX1Q9NSU2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX1Q9NSU2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX1Q9NSU2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX1Q9NSU2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX1Q9NSU2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX1Q9NSU2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREX1Q9NSU2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms