Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TM7SF3Q9NS93 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms