Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHST12Q9NRB3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHST12Q9NRB3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHST12Q9NRB3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHST12Q9NRB3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHST12Q9NRB3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHST12Q9NRB3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHST12Q9NRB3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CHST12Q9NRB3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHST12Q9NRB3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHST12Q9NRB3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHST12Q9NRB3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHST12Q9NRB3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHST12Q9NRB3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHST12Q9NRB3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHST12Q9NRB3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHST12Q9NRB3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHST12Q9NRB3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHST12Q9NRB3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHST12Q9NRB3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CHST12Q9NRB3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHST12Q9NRB3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHST12Q9NRB3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHST12Q9NRB3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHST12Q9NRB3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHST12Q9NRB3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHST12Q9NRB3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHST12Q9NRB3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHST12Q9NRB3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHST12Q9NRB3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHST12Q9NRB3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms