Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA3

MID1IP1, Mid1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1IP1Q9NPA3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MID1IP1Q9NPA3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms