Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms