Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LIN28AQ9H9Z2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms