Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D3

XKR8, XK-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR8Q9H6D3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
XKR8Q9H6D3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms