Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM15Q9C019 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms