Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PCGF6Q9BYE7 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms