Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CARD11Q9BXL7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARD11Q9BXL7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms