Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PLVAPQ9BX97 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms