Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms