Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SYCP2Q9BX26 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms