Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NDC1Q9BTX1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms