Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPOCK3Q9BQ16 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms