Protein–RNA interactions for Protein: Q99986

VRK1, Serine/threonine-protein kinase VRK1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VRK1Q99986 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VRK1Q99986 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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