Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms