Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 AC003986.3-201ENST00000417460 692 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 AP000944.1-201ENST00000533886 564 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms