Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ANKRD27Q96NW4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms