Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms