Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2E2Q96LR5 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2E2Q96LR5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2E2Q96LR5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2E2Q96LR5 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2E2Q96LR5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2E2Q96LR5 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2E2Q96LR5 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2E2Q96LR5 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2E2Q96LR5 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2E2Q96LR5 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2E2Q96LR5 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2E2Q96LR5 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2E2Q96LR5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2E2Q96LR5 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2E2Q96LR5 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2E2Q96LR5 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2E2Q96LR5 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2E2Q96LR5 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2E2Q96LR5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2E2Q96LR5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBE2E2Q96LR5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms