Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms