Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms