Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTHRC1Q96CG8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms