Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIGD2Q96BF3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms