Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFKQ969G6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms