Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms