Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms