Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms