Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT28Q7Z3Y7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms