Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms