Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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TCF23Q7RTU1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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TCF23Q7RTU1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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TCF23Q7RTU1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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TCF23Q7RTU1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TCF23Q7RTU1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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