Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KNDC1Q76NI1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KNDC1Q76NI1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms