Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC80Q76M96 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC80Q76M96 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC80Q76M96 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC80Q76M96 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC80Q76M96 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC80Q76M96 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC80Q76M96 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC80Q76M96 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC80Q76M96 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC80Q76M96 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC80Q76M96 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC80Q76M96 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC80Q76M96 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC80Q76M96 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC80Q76M96 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC80Q76M96 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC80Q76M96 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC80Q76M96 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC80Q76M96 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC80Q76M96 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC80Q76M96 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC80Q76M96 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC80Q76M96 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC80Q76M96 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC80Q76M96 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC80Q76M96 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC80Q76M96 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC80Q76M96 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC80Q76M96 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC80Q76M96 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC80Q76M96 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC80Q76M96 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms