Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q71RC1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q71RC1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q71RC1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q71RC1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q71RC1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q71RC1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q71RC1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q71RC1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q71RC1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q71RC1 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q71RC1 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q71RC1 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q71RC1 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q71RC1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q71RC1 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q71RC1 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q71RC1 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q71RC1 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q71RC1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q71RC1 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q71RC1 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q71RC1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q71RC1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q71RC1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q71RC1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q71RC1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q71RC1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q71RC1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q71RC1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q71RC1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q71RC1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q71RC1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q71RC1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q71RC1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q71RC1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q71RC1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q71RC1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q71RC1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q71RC1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q71RC1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Q71RC1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Q71RC1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q71RC1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q71RC1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q71RC1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q71RC1 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q71RC1 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q71RC1 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q71RC1 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q71RC1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q71RC1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q71RC1 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q71RC1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q71RC1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Q71RC1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q71RC1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q71RC1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q71RC1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q71RC1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q71RC1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q71RC1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q71RC1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q71RC1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q71RC1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q71RC1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q71RC1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q71RC1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q71RC1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q71RC1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q71RC1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q71RC1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Q71RC1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q71RC1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q71RC1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q71RC1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q71RC1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q71RC1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Q71RC1 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q71RC1 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q71RC1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q71RC1 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Q71RC1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q71RC1 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q71RC1 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q71RC1 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q71RC1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q71RC1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Q71RC1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q71RC1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q71RC1 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Q71RC1 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q71RC1 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q71RC1 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q71RC1 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Q71RC1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q71RC1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q71RC1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Q71RC1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q71RC1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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