Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP34Q70CQ2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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